中新基因组剖析体型最庞大的硬骨鱼

记者 闻坤 文/图
2016-09-09 22:36
摘要

9日,来自深圳国家基因库和新加坡A*STAR研究所的研究人员,包括诺贝尔奖获得者Sydney Brenner在内组成的研究团队首次破译了世界上最大的硬骨鱼——翻车鱼(Molamola, 又称海洋太...

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翻车鱼在全世界的热带海水中都能找到,而且经常被误认为鲨鱼,特别是当它们巨大的背鳍露出水面时。翻车鱼喙状牙板无法完全闭合。

翻车鱼是世界上最大、形状最奇特的鱼之一。它们的身体又圆又扁,像个大碟子。鱼身和鱼腹上各有一个长而尖的鳍,而尾鳍却几乎不存在,它们因此看上去好像后面被削去了一块似的。翻车鱼主要以水母为食,用微小的嘴巴将食物铲起。它们常常在水面晒太阳,尽管其形状笨拙,但有时也会跃出水面。

翻车鱼是河豚科的巨型亲戚,是所有多骨鱼中最重的鱼种,体重可达3000千克。早在30年代,美国自然史博物馆的鱼类学家古格就曾对翻车鱼进行过研究,并宣称巨大的翻车鱼是动物界的生长冠军。它们的幼鱼仅有0.25厘米长,而长到成年鱼时可达3米长,体重比幼鱼时增加了6000万倍。虽然翻车鱼体重可达2吨半,但它性情温和可接近。

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9日,来自深圳国家基因库和新加坡A*STAR研究所的研究人员,包括诺贝尔奖获得者Sydney Brenner在内组成的研究团队首次破译了世界上最大的硬骨鱼——翻车鱼(Molamola, 又称海洋太阳鱼)的基因组,并在开放期刊GigaScience上公布了其研究成果。翻车鱼基因组研究发现了许多特异性的基因变化,这些变化也许可以解释其快速的生长速率、巨大的体形和不同寻常的骨骼形态。

项目发起人和共同负责人、来自新加坡A*STAR 研究所的Byrappa Venkatesh说:“我们在2002年对河豚进行了全基因组测序,在当时是第二个测了全基因组的脊椎动物。河豚和翻车鱼属于同一目但在形态上有明显的不同。所以为了找出翻车鱼所发生的遗传变化,我们针对翻车鱼进行全基因组测序并和河豚的基因组进行比较,这可以为我们研究翻车鱼及其特异的表型提供线索。”他们发现,翻车鱼拥有和河豚类似的Hox基因簇,但不能排除这可能是Hox基因簇在翻车鱼里有不同的调控方式。

通过重点研究翻车鱼快速的生长速率和独特体形的遗传背景,该项目的负责人潘海林指出:“相比其他的硬骨鱼,一些和生长激素信号通路相关的基因在翻车鱼里面发生快速进化,这也许可以解释翻车鱼如此巨大的体形和快速的生长速率。”

编辑 欧阳炜

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