深圳先进院在《自然·微生物学》杂志刊文 揭示合成生物个体建构原理

读特记者 闻坤 文/图
2020-05-19 09:52
摘要

5月18日,中国科学院深圳先进技术研究院、深圳合成生物学创新研究院刘陈立团队在国际权威学术期刊《自然·微生物学》杂志发表文章,提出关于细胞分裂控制机制的新观点。

小小的细胞蕴藏着无数的生命奥秘,过去100年来,生物学家一直想知道是什么决定了细胞的大小。在近代,虽然我们知道了大部分控制细菌细胞周期和细胞分裂的分子,但我们仍然不知道细菌细胞的大小是如何确定的。5月18日,中国科学院深圳先进技术研究院、深圳合成生物学创新研究院刘陈立团队在国际权威学术期刊《自然·微生物学》杂志发表题为《链接大肠杆菌细胞生长和细胞周期的一般定量关系》的文章,以大肠杆菌为模式生物,修正该研究领域原有法则,发现了决定细菌细胞大小的"个体生长分裂方程",并提出关于细胞分裂控制机制的新观点。

文章在国际权威学术期刊《自然·微生物学》杂志上线

上世纪50年代,美国科学家发现了细菌生长的两大法则,半个世纪以来一直统治着微生物生理学领域。刘陈立团队潜心3年多研究发现,原有法则并不准确。"虽然生长速度越快,细胞越大,但二者之间的关系并不符合两大法则的预期。"刘陈立说,"按照法则描述,无论细胞生长快慢,一旦达到'起始质量',就应该开始新一轮的DNA复制,然而,我们却在实验中观察到,细菌细胞没有遵循假说,不同培养条件下,'起始质量'有高有低。"

个体生长分裂方程

为了回答"细菌细胞大小如何决定"这一科学问题。研究团队通过寻找大量数据背后的量化关系,最终发现了一个全新且适用于不同生长速率条件的"个体生长分裂方程"。

该文章第一作者郑海博士表示,他们选择超过30种培养基开展实验,对细胞的生长状态进行实时监控,实验重复次数多的超过9次以上。这是迄今为止有报道的类似研究工作中选用培养基种类最多、覆盖生长速率范围最广的一次。

研究团队提出一个全新的分子机制假说,认为存在一种"分裂许可物",它与"细胞生长"和"染色体复制分离"相关。当它积累达到一定阈值时,细胞就会分裂。基于此观点,研究团队建立了相应的数学模型,进一步的实验确实验证了理论预测。

不同大小的细菌细胞

新方程的提出使得细菌个体大小、生长速率等自然现象具有了一定的可预测性,例如:当得知细菌生长速率和DNA复制周期,便可准确预测出细菌的大小。

以"合成生物学"为研究导向,刘陈立团队继去年在《自然》发文揭示细菌群体迁徙公式后,该研究是在定量生物学领域的再度突破。

"研究再次证实了定量的思维方法在生命科学研究中的重要性,我们找到的每一个运行规律,都是试图找到可用于指导设计、改造、重建生命形式的'迷宫地图'。"刘陈立表示,此次对细菌个体细胞相关定量规律和法则的基础科学问题研究,对人类揭示并理解生命体内在原理提供了重要的参考依据,此研究也有助于未来合成生物学领域的理性设计和建构,以满足细菌治疗疾病、抗生素替代、绿色生物制造等多个应用层面的需要。

编辑 秦天

(作者:读特记者 闻坤 文/图)
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