华大基因完成裂谷热病毒基因组高通量测序
记者 闻坤 文/图
2016-08-03 00:13

2016年7月23日,我国出现首例输入性裂谷热病例,患者汤某在安哥拉出现发热且伴随头痛、肌肉痛、关节痛等症状,入境北京时病情严重,被送往某医院隔离治疗。

记者8月2日获悉,华大基因协助出入境检验检疫部门,对病例样本进行了高通量测序,在最短时间内成功获得了裂谷热病毒全基因组,并利用自主研发的高通量测序平台优势,全面鉴定了病人样本的微生物图谱,为临床干预和治疗提供了依据。

裂谷热(Rift Valley fever)是一种由裂谷热病毒(RVFV)引起的、节肢动物传播的急性传染病,主要在牛、羊等动物中传播,也能感染人,被世界动物卫生组织列为A类疫病及8种有可能大规模爆发的致命疾病之一。

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据悉,7月23日,广东出入境检验检疫局技术中心卫生检疫实验室和华大基因开始对从患者血样中提取的核酸样本进行RNA质量检测、高通量测序建库和测序,7月24日获得数据结果。经分析鉴定,科研人员发现样本内存在裂谷热病毒(暂名RVFV-Beijing),并将获得的序列与NCBI Genbank数据库进行比对分析,发现RVFV-Beijing三个基因组片段与曾在南非卡卡马斯发现的Rift Valley fever virus Kakamas isolate的三个相应片段高度相近,相似度均为98%。

首例输入性裂谷热病毒高通量测序是多部门合作的成功事件,也是华大基因对公共卫生事业的社会责任体现。华大基因曾多次参与国家突发公共卫生事件的应急处理,与相关合作单位一起完成了中国第一例SARS病毒的基因组序列、第一例感染人的高致病性禽流感病毒基因组序列、第一株感染人的猪链球菌的基因组序列、新型布尼亚病毒致发热伴血小板减少综合症的发现与诊断、并成功研制了人感染H7N9禽流感诊断试剂;德国2011年爆发大肠杆菌疫情后,华大基因是全球首个破译大肠杆菌全基因组的机构;2014年,非洲埃博拉疫情爆发后,华大基因还与中国疾控中心一起参与了援非计划,完成了上百株埃博拉病毒基因组的破译。

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