华大智造新技术可针对新型毒株提供有效监测
深圳特区报记者 闻坤
2021-12-01 17:54

记者1日获悉,华大智造新推出的试剂盒能够稳定地制备覆盖毒株全长序列的测序文库,搭配DNB测序和分析系统即可分型所有流行毒株。从阿尔法到奥密克戎,只需一套建库试剂,就可针对新型毒株提供简单有效的监测。

根据Nextclade最新的数据,奥密克戎变异株包含61个氨基酸突变,对应到核酸序列上有50个新型变异。

华大智造相关负责人表示,目前,基于多重PCR的测序技术是新冠毒株监测的主流技术,从Alpha(阿尔法)到Beta(贝塔),到Delta(德尔塔),再到最新的Omicron(奥密克戎),新冠病毒不断变异,每次变异都给以PCR技术为基础的测序监测技术带来了巨大的挑战。

据透露,基于多重PCR核心技术,华大智造ATOPlex平台推出V3.0版建库试剂盒应对疫情挑战。该型试剂盒采用双保险引物设计,在一次实验中同时对病毒基因组进行2次扩增,任意一管都可以扩增出接近新冠全长序列,有效降低由于病毒突变带来的失败风险。

该负责人表示,华大智造在第一时间拿到奥密克戎序列后就完成了对ATOPlex试剂盒的溯源性能评估,ATOPlex V3.0建库试剂盒联合DNBSEQ测序系统能够有效对奥密克戎毒株进行分析,基因组覆盖度超过99.2%,在鉴定新型突变的同时获取完整基因组序列。11月29日,华大智造帮助瑞典公共卫生局合作的卡罗林斯卡医学院国家疫情中心完成首例奥密克戎的监测。

“我们能在18小时内就能完成毒株全基因组组装和分型工作,帮助公共卫生监测系统快速、持续地对新冠变异情况进行跟踪。”该负责人表示,随着疫情的不断变化,华大智造将持续更新和优化包括建库测序系统在内的产品及平台,为新型突变和疫情监测提供更有力的工具保障,助力全球抗疫。

(原标题《华大智造新技术可针对新型毒株提供有效监测》)

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(作者:深圳特区报记者 闻坤)
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