华大基因参与发起“地球生物基因组计划”

记者 闻坤
2017-03-02 19:05
摘要

记者2日获悉,地球生物基因组计划(EBP)即将启动,目标是破译地球上所有生命的基因组。

生命科学领域又将迎来一件大事。记者2日获悉,地球生物基因组计划(EBP)即将启动,目标是破译地球上所有生命的基因组。华大基因作为该项目的发起单位之一,将使用自主研发的测序系统,与国际机构展开合作。该项目有助人类全面了解地球生命演化的奥秘,极大地推动物种保护工作的开展。

“EBP计划的意义重大。”以Harris Lewin, Gene Robinson, John Kress为代表的EBP工作组成员表示,这是第一个真正的全球大型基因组测序项目,能让世界上数千名科学家和数百万民众参与,所产出的超大数据超过1EB(相当于1亿部高清电影,播放2.3万年),将推动全新计算算法、分析方法和模型的创立,革新我们对生物学的理解,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务创造新的基因资源。

据科学杂志(Science)报道,EBP项目将首先集中完成约9330个真核生物科级别代表性物种的基因组,从而获得与人类参考基因组相当或比人类参考基因组更好的参考基因组。接着,在14万~20万个真核生物属中,对来自每个属的一个物种进行基因组草图绘制。最后,对剩下的150万个已知的真核生物物种的基因组进行低覆盖测序。这些精细度不同的基因组之间还能通过比较分析或进一步测序,帮助我们获知更多的信息。

研究者们完成该项目的信心来源之一,是不断下降的的测序成本与不断进步的测序技术。人类基因组计划之后,个人全基因组测序成本不断降低,由最初的30亿美元下降到现在的1000美元,甚至可能更低。作为全球最大的基因组学研发中心,华大基因已于2015-2016年相继推出了多款自主研发的测序系统,目前已具备量产测序仪的实力,也将运用这一优势,助力EBP项目的实施。

华大基因理事长杨焕明院士强调,EBP是一个真正的国际合作性项目,不仅应鼓励发展中国家参与,更要促进和扶持这些国家基因组学的教育和发展,以实现真正充分平等的合作。

据EBP项目组成员介绍,该项目尚未获得资金支持,初步预计完成整个项目大约需要40亿美元的投入,如获得这样的资金支持,该计划有望在10年内完成。

见习编辑 耿超逸

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