华大智造测序仪加持中国CDC&北京地坛医院发布新冠病例治愈成果

近期，一项关于新冠病毒早期病例的相关研究成果在国际期刊Frontiers in Medicine正式发表，该研究通过基因测序证实脑脊液中存在新冠病毒。该项目始于去年2月对首例新冠肺炎合并脑炎患者的研究，北京地坛医院联合中国疾病预防控制中心传染病预防控制所（以下简称“中国CDC传染病所”）对该患者脑脊液标本通过宏基因组测序获得了完整的新冠病毒基因组序列，表明SARS-CoV-2可以突破血脑屏障，侵入患者中枢神经系统，提示我们在对新冠肺炎患者评估时还需要关注神经系统感染。

据了解，在这项研究中。华大智造MGISEQ-200RS 和 MGISEQ-2000RS为中国CDC传染病所开展宏基因组测序和数据分析提供了测序技术支持。

研究者采集了该患者脑脊液，从中分别提取了DNA和RNA，建库后在华大智造基因测序仪MGISEQ-200RS 和 MGISEQ-2000RS上进行宏基因组测序。采用超高深度高通量测序，从RNA文库中获得了209,119,576 reads的原始数据，并且获得了长度为29,857bp的SARS-CoV-2基因组。通过与已知SARS-CoV-2参考基因组比对发现，从该脑脊液样本中测得了完整的SARS-CoV-2病毒基因组序列，与早期武汉流行毒株序列最为相似。

这是目前首例报道的从脑脊液中测序出SARS-CoV-2完整序列的案例，表明SARS-CoV2已经存在于神经系统，在临床治疗中需要密切关注新冠肺炎患者的神经系统症状。同时也表明基因测序可以作为由特殊病原体引起的特定传染病的临床诊断方法之一。

目前，针对病毒样本的全基因组测序已成为多地疫情防控的常态，这其中，华大智造基因测序仪呈现强势助力之势。之前，在破解进口冷链新冠病毒全基因组测序难题中，山东省济南市疾控中心依托MGISEQ-200平台，解决了弱阳性样本低病毒载量时难以获得全基因组序列的困难。在疫情趋于稳态控制之时，佛山市疾控中心借助MGISEQ-200测序仪及配套产品成功搭建首个常态化市级测序技术平台，也为其他地区常态化疫情防控工作提供了宝贵经验。

凭借在高通量测序方面的卓越表现，华大智造已经成为助力我国医疗系统和CDC系统合作的关键力量，北京地坛医院联合中国CDC打造的医防协同诊断平台的背后，便有着华大智造的全力支持。对此华大智造表示，将不断为我国传染病防控强势赋能，持续为我国新发突发传染病诊疗救治和早期防控提供强有力的测序技术支持，助力构筑公共卫生安全“防护网”。

编辑 张克 审读 刘春生 审核 张雪松 李林夕