华大智造助力完成国内首例输入性猴痘病例病毒溯源
深圳特区报首席记者 闻坤
2022-09-20 20:32

9月19日,《中国疾病预防控制中心周报(China CDC Weekly)》公布中国内地首例输入性猴痘病例相关信息:一名中国籍男子在9月14日回国,被重庆市疾控中心确定为猴痘疑似病例。

9月16日,采集的该男子的临床样本被送往中国疾病预防控制中心,进行了qPCR检测,并基于华大智造最新款基因测序仪DNBSEQ-G99等设备完成了全基因组测序。

值得一提的是,华大智造基于全新技术打造的最新款基因测序仪DNBSEQ-G99,助力此次溯源测序在短时间内得到了高度可信的毒株序列全长。面对qPCR检测Ct值为21左右的样本时,三种不同读长宏基因组测序统计猴痘病毒特异性reads平均约占0.35%。分析结果显示在读长为SE40时,猴痘病毒基因组平均深度约为35X;SE100时,其平均深度约为110X;PE100时,其平均深度约为200X,100X以上覆盖度大于99.03%。在实验全流程第9小时获得第一批下机结果,助力疾控系统应急溯源能力进一步提升,更高效地为快速制定相应防疫政策提供科学依据。

(原标题《华大智造助力中国疾控中心完成重庆输入性猴痘病例病毒溯源》)

见习编辑 秦涵 审读 韩绍俊 审核 关越

(作者:深圳特区报首席记者 闻坤)
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