华大参与发布非人灵长类动物单细胞图谱, 助力新冠药物和疫苗研发
读特记者 袁斯茹
2020-04-16 11:04

近日,记者从华大获悉,由其参与建立的食蟹猴单细胞转录组数据库,鉴定出了食蟹猴的44种主要细胞类型,在国际上首次完成了构建非人灵长类单细胞图谱,对于新冠药物和疫苗的研发具有指导作用。

△食蟹猴细胞图谱

据悉,该研究应用华大智造自主研发的便携式单细胞系统,对食蟹猴的肺、肾脏、肝、胰腺等主要组织器官进行测序。相关成果已由深圳华大生命科学研究院、深圳国家基因库、中科院广州生物医药与健康研究院等机构联合发表在生命科学平台bioRxiv上。

△深圳国家基因库高通量数字化平台

文章通讯作者之一、华大生命科学研究院超级细胞所所长刘龙奇表示,非人灵长类动物与人类在解剖生理、组织器官功能以及免疫应答反应等方面非常接近,是当前药物、疫苗研发以及新冠感染机制研究最理想的动物模型。“我们与合作单位一起率先公开第一批非人灵长类动物单细胞图谱,覆盖了病毒易感的主要器官类型,并与相应的人体细胞图谱进行了系统比较,发现了人和猴在受体表达上的一致性和部分差异,这将为新冠病毒相关的临床前研究提供重要的数据基础。”刘龙奇说。

据悉,本研究基于上述单细胞数据库,系统分析了新冠病毒受体ACE2及其辅助蛋白酶TMPRSS2在食蟹猴44种细胞类型上的表达情况,发现ACE2主要表达在肺,肾脏,肝脏的上皮细胞,而在血液和大脑皮层组织中几乎不表达。通过对ACE2在44种细胞中表达比例的排序,发现了各个器官中新冠病毒易感的细胞类型。

进一步,通过对ACE2和TMPRSS2的共表达分析以及后续的分析,发现肺部的一种上皮细胞是ACE2和TMPRSS2双阳性细胞比例最高的细胞类型,提示这种肺部上皮细胞类型极易受到新冠病毒的侵入。

(深圳商报供稿)

编辑 梁佳彤

(作者:读特记者 袁斯茹)
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